離島開業證照地圖：澎湖金門連江的窗口、規費與跨海送件時序

作者 Bo Wei・偉騰開發興業有限公司・發布 2026-09-09・更新 2026-09-09（由前臺東縣環境保護局局長謝清泉主持）

在澎湖、金門、連江開店，行號的商業登記在縣政府，公司登記卻不在縣政府而在經濟部工商輔導中心，稅籍分屬南區與北區國稅局的分局、稽徵所與服務處，衛生、消防、建管、環保各縣局處名稱又不同。本文把三縣的窗口、規費與跨海送件時序畫成一張開業證照地圖。

離島開店的證照邏輯和本島相同，四條線並行：商業或公司登記、稅籍登記、目的事業許可與登錄、勞健保與勞退；不同的是窗口的位置與名稱。行號登記在各縣政府的產業或建設局處，公司登記卻要送到經濟部設在南投的工商輔導中心，稅籍分屬財政部南區與北區國稅局的離島據點，這三件事沒先弄清楚，跨海送件就會白跑。

常見的直覺錯誤是把三個離島縣當成一套規則。

金門在民國114年1月把建設處拆成城鄉發展處與產業發展處，商業登記改歸產業發展處；澎湖的商業登記與建管審查仍集中在建設處；連江的商業登記由產業發展處工商科受理，訴願決定書卻由行政處發布。

窗口名稱一錯，公文就寄到已經不存在的單位。

以下依序拆解離島的四條線與三縣窗口、公司登記與稅籍的跨海動線、衛生與消防的在地規則、建管招牌與環保的依據、審查端的檢核順序，以及三縣的服務中心、線上申辦與訴願窗口。偉騰開發興業由前臺東縣環保局長領軍，離島案件我們用同一套審查桌的順序先幫你對表，讓每一趟跨海送件都有結果。

判斷框架：離島開店的四條線，差別在窗口位置而不在規則

澎湖、金門、連江開店同樣要走四條線：商業或公司登記、稅籍登記、衛生與消防等目的事業許可與登錄、勞健保與勞退。規則與本島一致，差別在三件事。

1. 第一，行號的商業登記在縣政府，但公司登記不在縣政府：實收資本額未達5億元的公司，三離島縣都送經濟部設在南投的工商輔導中心，線上則走經濟部一站式線上申請作業。
2. 第二，稅籍登記分屬兩個國稅局：澎湖歸財政部南區國稅局澎湖分局，金門歸北區國稅局金門稽徵所，連江歸北區國稅局馬祖服務處。
3. 第三，三縣局處名稱各異，金門自民國114年1月起商業登記歸產業發展處、建管歸城鄉發展處，澎湖兩者仍在建設處，連江商業登記由產業發展處工商科受理。

先把這三件事對好，再談送件。

商業登記三縣窗口：規費一致、動線各自不同

規費全國一致，依《商業登記規費收費準則》第2條名稱及所營業務預查每件300元、網路申請150元；第3條設立與變更登記每件1,000元、網路申請減徵二成，停業、復業、歇業免收；第5條經理人登記500元；第6條證明書每份300元、同次第二份起100元。

動線則看縣：澎湖由建設處工商發展科受理，縣府線上申辦服務系統標示送件後五到七日，並在核准後把案件轉送國稅局，民眾一次申請即辦妥商業登記與稅籍登記兩項；申請前另有「營業場所土地使用分區管制與建築管理規定查詢表」供設立、遷址、新增營業項目時先確認場所合法。

金門由產業發展處工商及投資發展科受理，官網商業登記專區列出應備文件與規費一覽表，抄本每份10元；連江由產業發展處工商科受理，規費依縣府114年12月30日的規費徵收項目及收費基準一覽表。

公司登記與稅籍：跨海的兩條線怎麼併

公司登記不必飛到南投：經濟部「公司與商業及有限合夥一站式線上申請作業」可從名稱預查或設立登記進入，同時勾選稅籍登記與成立勞健保投保單位，系統把案件與應備文件一併送到稽徵機關，設立核准後投保單位同步成立；進度用經濟部公司登記案件進度查詢系統看。

稅籍的時點依《加值型及非加值型營業稅法》第28條在開始營業前，總機構與每一個固定營業場所分別登記；未併案者，開始營業前把負責人身分證明、章程與許可文件影本送到營業所在地的稽徵機關。

離島業者最常漏掉的是「行號」這一段：商業登記核准不等於稅籍完成，澎湖雖有縣府代轉國稅局的一次申請機制，金門與連江仍要自己確認稽徵所或服務處的收件。勞健保則在僱用員工後才能成立投保單位，只有負責人一人時只能先成立健保投保單位。

衛生窗口與營業衛生自治條例：登錄始得營業

餐飲與食品零售依《食品安全衛生管理法》第8條，經公告類別及規模者要先在食品藥物業者登錄平台完成登錄始得營業，三縣衛生機關都把入口掛在官網：澎湖縣衛生局食品藥物管理科承辦食品業者登錄與餐飲稽查，115年度並辦餐飲衛生管理分級評核；金門縣衛生局辦餐飲從業人員與持證廚師的繼續教育衛生講習；連江縣衛生福利局由食藥暨綜合業務承辦。

營業衛生另有縣自治條例：《金門縣營業衛生管理自治條例》民國113年7月18日修正後，第4條要求營業場所負責人指定衛生管理人員並每年訓練4小時以上，第13條情節重大者得命停止營業3日至7日；澎湖亦訂有營業衛生管理自治條例，旅館、美容美髮、浴室等場所開業前先確認衛生管理人員與健康檢查要求。

消防檢修申報：附表一頻率、申報文件與三縣受理科

消防依《消防安全設備檢修及申報辦法》第5條按附表一的頻率與期限申報，第9條申報文件含檢修報告書、使用執照、營業登記文件與委託他人申報時的委託書，第12條新取得使用執照或室內裝修合格文件的場所，期限落在核發日起六個月或一年內者該次得免申報。

受理科三縣不同：

• 澎湖由消防局火災預防科承辦檢修申報、審勘與防火管理，線上走內政部消防署系統；
• 金門由消防局災害預防科受理，防火管理人講習歷年在金門大學開班，初訓12小時、複訓6小時，每期以50名為限；
• 連江消防局官網設有檢修制度與防火管理須知專頁。

離島的消防設備師與設備士人力有限，檢修排程要比本島更早敲定，免得申報期限到了卻約不到人。

建管、招牌與環保：三縣無自訂招牌法規，直接適用中央辦法

使用執照、變更使用與室內裝修，澎湖找建設處建築管理科，同科也受理招牌許可與拆除、建築物公安申報及營利事業登記配合審查；土地使用分區證明與營業登記審查在城鄉發展科，縣府另有都市計畫土地使用分區查詢及申請系統。

金門找城鄉發展處建築管理科與都市計畫科，連江找工務處都計建管科。

招牌三縣都查無縣級廣告物自治條例，直接適用《招牌廣告及樹立廣告管理辦法》：第3條正面式縱長未超過2公尺、側懸式未超過6公尺、地面樹立未超過6公尺、屋頂樹立未超過3公尺者免申請雜項執照，但第5條規定所有招牌廣告仍應向縣主管建築機關申請審查許可；第4條側懸式突出牆面不得超過1.5公尺、車道上方淨高4.6公尺以上、其他3公尺以上，正面式突出不得超過50公分；第12條許可有效期限5年。

金門另有招牌廣告安全巡查計畫，每年4月至11月每月巡查一次。環保陳情三縣共用環境部公害污染陳情系統，金門縣環保局另設公害陳情專線並訂有115年度餐飲業空氣污染防制設備補助要點，澎湖縣環保局公害防治科主管噪音與空氣污染。

審查端在看什麼與漏辦的代價：先許可後登記、先登記後級別證

離島審查桌看的順序和本島一樣，但更常卡在「順序」。

1. 第一看許可業務是否先取得許可文件再登記，《商業登記法》第6條與《公司法》第17條都把許可文件列為登記前提。
2. 第二看特定行業的兩段式：電子遊戲場業依《電子遊戲場業管理條例》第11條先辦妥公司或商業登記，再向縣政府申請營業級別證始得營業，澎湖由建設處工商發展科、金門由產業發展處核發；第9條規定營業場所應距離國民中小學、高中、職校、醫院50公尺以上，澎湖另訂有電子遊戲場業設置管理自治條例。金門的資訊休閒業另有縣自治條例，菸酒零售在金門有專屬的菸酒牌商號登記。
3. 第三看登錄與申報是否已進系統，衛生與消防都是聯合稽查的核對來源。

漏辦的代價直接落在負責人：未辦商業登記營業依《商業登記法》第31條限期補辦，逾期處1萬元至5萬元罰鍰並得按次處罰；未領級別證經營電子遊戲場依第15條另有刑事責任規定，違反第14條依第27條處負責人20萬元至100萬元罰鍰。

在地窗口與申請動線：服務中心、線上入口與跨海送件時序

澎湖縣政府在縣府一樓設為民服務中心與詢問臺，受理申請案件查詢與協調，線上申辦服務系統首頁標示單一窗口、申辦服務與進度查詢，1999縣民服務專線每日七時至二十二時服務；訴願由縣政府訴願審議委員會審議，委員五至十五人。

金門縣政府的線上入口是網路e櫃台，查證當日服務項目頁故障，實務以產業發展處商業登記專區的應備文件與各式申請表為準。連江縣政府的訴願決定書由行政處發布，為民服務資料每季公布執行管制表。

跨海送件的時序建議是：

• 先在本島把預查、章程、負責人文件與場所使用權證明備齊，澎湖用縣府一次申請機制把商業登記與稅籍併送，金門與連江則在商業登記核准後立即向稽徵所或服務處辦稅籍；
• 郵寄補正一律用掛號，依《行政程序法》第49條以交郵郵戳為準；
• 消防檢修申報與招牌許可趁裝修期並行，食品業者登錄壓在開幕前完成。

自我檢查清單

• 已確認行號登記窗口是澎湖建設處工商發展科、金門產業發展處工商及投資發展科或連江產業發展處工商科，不是舊的建設處名稱
• 公司登記已改送經濟部工商輔導中心或由一站式線上申請作業送件，並勾選是否併案稅籍登記與成立勞健保投保單位
• 已記下所屬稽徵機關：南區國稅局澎湖分局、北區國稅局金門稽徵所或馬祖服務處，商業登記核准後立即辦稅籍
• 餐飲與食品零售已在食品藥物業者登錄平台完成登錄，金門營業衛生場所已指定衛生管理人員並安排每年4小時訓練
• 已依《消防安全設備檢修及申報辦法》附表一排定檢修頻率，新取得使用執照者已確認第12條該次免申報的適用
• 招牌尺寸已對照《招牌廣告及樹立廣告管理辦法》第3條與第4條，並向縣主管建築機關申請審查許可
• 電子遊戲場、資訊休閒業等特定行業已確認先登記後級別證或許可的順序，以及與學校醫院的法定距離

常見錯誤

• 把公司登記申請書寄到縣政府——三離島縣的公司登記受理機關是經濟部工商輔導中心，寄錯機關等於沒送件
• 沿用金門「建設處工商發展科」舊窗口——民國114年1月起商業登記歸產業發展處，公文寄到不存在的單位會被退回
• 以為澎湖以外也有縣府代轉國稅局——金門與連江的稅籍登記要自己向稽徵所或服務處辦，漏辦依《加值型及非加值型營業稅法》第45條處3,000元至3萬元
• 小型招牌不申請許可——免的是雜項執照，《招牌廣告及樹立廣告管理辦法》第5條仍要向縣主管建築機關申請審查許可
• 電子遊戲場先開店再補級別證——依《電子遊戲場業管理條例》第15條未領級別證不得經營，另有刑事責任規定，登記與級別證的順序不能倒

官方參考資料

• 商業登記規費收費準則（全國法規資料庫）
• 招牌廣告及樹立廣告管理辦法（全國法規資料庫）
• 澎湖線上申辦服務系統
• 金門縣政府產業發展處 商業登記專區

常見問題

在澎湖或金門開公司要送縣政府嗎？

不是。三離島縣實收資本額未達5億元的公司登記，受理機關是經濟部設在南投的工商輔導中心，縣政府只受理行號的商業登記。實務上用經濟部一站式線上申請作業送件即可，不必親赴南投，還能同時勾選稅籍登記與成立勞健保投保單位；進度用經濟部公司登記案件進度查詢系統查。

金門開店的商業登記現在找哪個處？

找金門縣政府產業發展處工商及投資發展科。金門在民國114年1月把建設處拆成城鄉發展處與產業發展處，商業登記、電子遊戲場級別證、攤販與工廠登記歸產業發展處，建築執照、使用管理與土地使用分區證明歸城鄉發展處。官網商業登記專區有應備文件與規費一覽表，預查300元、設立與變更各1,000元、抄本每份10元。

離島開餐廳，消防和招牌要辦什麼？

消防依《消防安全設備檢修及申報辦法》第5條按附表一的頻率申報，申報文件含檢修報告書、使用執照與營業登記文件，新取得使用執照或室內裝修合格文件者依第12條該次可能免申報；澎湖由消防局火災預防科、金門由災害預防科受理。

招牌三縣都直接適用《招牌廣告及樹立廣告管理辦法》，小型招牌免雜項執照但仍要申請審查許可，許可有效期限5年。

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