離島水污許可實務：澎金馬三局窗口、水庫保護區與下水道接管優先
澎湖、金門、連江三縣沒有產業園區、沒有農田水利署管理處，事業廢水的出口只有海、水庫集水區與公共污水下水道；澎湖六座、金門十一座水庫是飲用水水源水質保護區，金門的湖庫全數優養化，連江把下水道使用費與家戶水污費寫進自治法規。本文把事業門檻、水措計畫、許可申請、放流水標準、水污費、檢舉獎勵與三縣窗口寫成一張地圖。
離島的廢水規則跟本島差在出口：澎湖、金門、連江都不在產業園區管理局的園區清單，也不在農田水利署十七個管理處的轄區，事業廢水要嘛排海、要嘛排進水庫集水區的溝渠、要嘛接進公共污水下水道，沒有工業區專用系統與圳路搭排這兩條路。《水污染防治法》第14條要求排放廢水於地面水體者先取得排放許可證或簡易排放許可文件，離島的第一個問題是廠址離哪座水庫多近、能不能接管。
三縣的主管機關各有樣子：澎湖縣政府環境保護局把水污防治與稽查處分放在公害防治科，申辦業務作業流程圖有水污染防治各項許可申請含展延變更的流程圖與水污專責人員設置流程圖，表單區備一般、社區專用污水下水道系統、畜牧業三種申請表與試車計畫書；金門縣環境保護局水質保護科掌水污染防治、土壤、海洋、飲用水檢驗與公害糾紛陳情，業務頁寫明各湖庫卡爾森指數均屬優養化並辦理事業許可證換發與輔導新增事業取得許可；連江縣環境資源局分三科，工廠登記的環保許可在環境管理科、用戶排水審查與下水道裁處在資源管理科、事業廢水管理與稽查處分在污染防治科。
偉騰開發興業由前臺東縣環保局長帶隊，處理過離島餐飲旅宿、酒廠與食品廠、畜牧場、水產加工與海水淡化相關設施的水污染防治措施計畫、排放許可證與簡易排放許可文件申請、定期檢測申報與水污費申報、廢水專責人員設置，全台各縣市受理。以下依澎湖縣政府環境保護局、金門縣環境保護局、連江縣環境資源局與三縣主管法規系統的公開資料，把門檻、程序、審查重點、裁罰與在地窗口逐段講清楚。
離島哪些事業要辦水污許可：三縣的事業樣貌、事業分類門檻與只有三種出口的三層門檻
離島的事業廢水來源集中在餐飲旅宿、酒廠與食品加工、畜牧、水產加工與漁港設施：澎湖環保局有餐飲業管理法規及污染防制實務與露營場環境保護事項申請及審查指引兩份文件，金門的金酒公司廠區被低碳島自治條例點名、環保局另有96年菸酒業環保項目申辦頁，連江的馬祖酒廠是縣府所列事業機構、環境資源局115年3月2日訂補助油脂截留設施作業要點針對餐飲業廢水油脂。要不要辦許可先對環境部110年4月16日修正的水污染防治法事業分類及定義公告：餐飲業與觀光旅館每日最大廢水量五十立方公尺以上，或餐飲座位五百人、作業環境面積一千五百平方公尺、客房七十五間、湯屋二十五間以上；食品製造、醱酵與酒類製造二十立方公尺以上、自來水水質水量保護區內十；畜牧業養豬二十頭以上、保護區內十頭，飼養豬未滿二百頭者免許可免檢測申報；水產加工與其他工業二十立方公尺以上，或廢水含鉛、鎘、汞、砷、六價鉻、銅、氰化物超過放流水標準；洗車場二十立方公尺以上或用水每日二十四、每月七百二十立方公尺以上。依《水污染防治法》第13條，設立或變更前先送水污染防治措施計畫；依第14條，排放廢水於地面水體前先取得排放許可證或簡易排放許可文件。三層門檻在離島少了一層：每日最大廢水量一百立方公尺以上或原廢水含專責辦法附表二物質超標者先送水措計畫，納入工業區專用系統這一款在三縣用不上；排放許可證與簡易排放許可文件的分界依審查管理辦法附表二，一百立方公尺以上、含附表二物質超標或有重大違規紀錄申請許可證，其餘申請簡易文件，附表二自115年10月1日施行；廢水全量納入公共污水下水道者不是排放於地面水體，不辦許可但受納管水質管，連江的污水下水道使用費徵收自治條例把用戶分一般、事業、投肥三類，事業用戶就是《水污染防治法》第2條第7款的事業排入下水道者。海洋放流也是排放於地面水體，照樣要許可。
離島怎麼送件：澎湖流程圖與四種申請表、金門檢核表與換發、連江三科分機與環境部系統時程
澎湖縣政府環境保護局位於湖西鄉大城北6-1號，電話06-9221776、06-9221778、06-9221779、06-9221781，水污防治與稽查處分在公害防治科；申辦業務作業流程有十八項，含水污染防治各項許可申請（含展延、變更）作業流程圖與環境保護專責單位或人員設置申請作業流程圖的水污版本，表單下載區有水污染防治措施計畫及水污染防治許可證（文件）申請表、廢（污）水處理設施及污泥處理設施試車計畫書、社區專用污水下水道系統版申請表、畜牧業版申請表與2025年6月5日的水污染防治法規簡介。金門縣環境保護局位於金湖鎮正義里尚義100號、總機082-336823，水污染防治在水質保護科，業務申辦流程頁有水污染防治網路申請（報）作業與工廠申請相關事項，後者放了109年4月16日的工廠應取得環保許可文件檢核表各項申請環保許可文件諮詢窗口及諮詢專線與109年2月24日的工廠應取得環保許可文件自我檢核表及附件，新設工廠先填檢核表再送件，環保局同時辦理縣內事業許可證換發並輔導新增事業設置污染防治措施及取得許可。連江縣環境資源局位於南竿鄉復興村214-3號，電話0836-26517到26520，工廠登記的環保許可洽環境管理科分機160，事業廢水管理與稽查處分洽污染防治科分機260，用戶排水審查與下水道法規裁處洽資源管理科分機120。三縣送件本體都在環境部環境保護許可管理資訊系統以工商憑證或自然人憑證簽章，115年3月24日修正的水污染防治措施計畫及許可申請審查管理辦法的時程一致：程序審查十日、實體審查二十日，涉試車、現勘或專家審查五十日，特定對象風險評估九十日，展延案七日加十四日、涉現勘二十日，必要時延長以三十日為限；補正日數不計入且總補正不得超過四十二日，審查意見一次提供；核准後十四日內通知、十四日內繳費領證；試車最長九十日、得展延一次九十日。依第3條，未附設洗車場的加油站、營建工地、飼養豬未滿二百頭的畜牧業、貯存系統、全量農地肥分使用的畜牧業與洗腎診所不必申請許可。規費依水污染防治各項許可申請收費標準：排放許可證依專責規模四級，網路一萬六千、一萬二千、八千、四千元，書面二萬到五千元；簡易排放許可文件網路一千九百元、書面二千四百元；水措計畫網路一萬二千八百到三千二百元；證書費五百元、試車計畫書三千元；三縣自訂的環保許可規費標準都未查得，以中央為準。
離島審查端在看什麼：放流水標準、澎湖六座與金門十一座水庫保護區、優養化湖庫與海洋放流
排入地面水體的廢水依113年12月18日修正的放流水標準：酸鹼值六點零到九點零；水溫規定排放於非海洋地面水體者五月至九月三十八度以下、十月至翌年四月三十五度以下，直接排海者無水溫限制但其他項目照管；餐飲業生化需氧量五十、化學需氧量一百五十、懸浮固體五十、大腸桿菌群每百毫升三十萬，觀光旅館三十、一百、三十、二十萬；食品製造與酒類製造生化需氧量三十、化學需氧量一百、懸浮固體三十；非草食性畜牧業八十、六百、一百五十；重金屬通用值銅三點零、鋅五點零、總鉻二點零、六價鉻零點五、鎳一點零、鎘零點零三、鉛一點零、總汞零點零零五、砷零點五毫克每公升。三縣是否依《水污染防治法》第7條訂加嚴放流水標準本文未能確認。離島審查最重的一項是水庫：環境部地理資訊網列澎湖縣劃定成功水庫、東衛水庫、興仁水庫、小池水庫、西安水庫、七美水庫六處飲用水水源水質保護區，金門縣劃定太湖、榮湖、田浦水庫、擎天水庫、西湖、菱湖、蓮湖、陽明水庫、瓊林水庫、金沙水庫、山西水庫十一處，八十六處保護區清單未列連江縣；區內事業門檻減半、依《飲用水管理條例》第5條禁止設置污染性工廠等行為，放流水另適用氨氮十、正磷酸鹽四點零、硼一點零的加嚴值。金門環保局業務頁寫明各湖庫卡爾森指數均屬優養化，正推動太湖、榮湖水庫污染整治規劃與初步設計，排入這兩座水庫集水區的酒廠、餐飲與畜牧廢水的氮磷會被特別看，環保局公開河川湖庫水質檢驗值報告與重大點源放流水自動連續監測資訊。排海的事業另受海洋污染防治法約束，金門有海域水質監測報告與蛤類檢測報告，海洋放流管的位置與擴散是審查會問的。《水污染防治法》第18條之1的三項禁令在離島同樣適用：不得繞流、不得以無須處理之水稀釋、緊急繞流三小時內通知，登記操作參數容許正負百分之十。
離島的定期檢測申報、水污費與專責人員：金門八項五項檢測、重大點源連續監測、家戶水污費與下水道使用費
許可到手後的申報頻率依115年4月20日修正的水污染防治措施及檢測申報管理辦法：一般事業每六個月一次，一月底前申報前一年七至十二月、七月底前申報當年一至六月；應設專責單位或甲級專責人員且排放地面水體者每三個月一次，一、四、七、十月底前申報；免設專責人員的社區專用污水下水道系統每年一次。檢測時產生量須達核准每日最大量的百分之六十以上，放流口設在作業環境外並備採樣平台、獨立專用累計型水量計與長三十二公分寬十五公分白底黑字告示牌，水量計每年校正、紀錄與佐證保存五年，每日核准排放量一千五百立方公尺以上設自動監測連線，金門環保局公開的重大點源放流水自動連續監測資訊就是這類事業的數據。金門環保局業務頁另寫明對列管事業廢污水檢測八項、畜牧場五項，這是主管機關端的查核採樣。水污費依114年3月31日修正的收費辦法，費額是各項目費率乘排放水質乘排放水量，每年一月三十一日前申報繳納前一年七至十二月、七月三十一日前申報繳納當年一至六月，先繳費再網路申報；排放水質占標準比例逾六成至八成收八成、逾四成至六成收六成、逾三成至四成收四成、一成以上至三成收一成五，濃度小於標準一成或當期費額未達五十元免繳仍須申報，全量納入公共污水下水道者免辦檢測申報、免繳水污費。三縣的家戶端另有法規：金門縣家戶水污染防治費收費辦法115年8月12日訂定，縣府依下水道法公告下水道使用區域內的家戶於公告日起六個月後未將污水排洩於下水道者應繳納水污染防治費；連江縣家戶水污染防治費徵收辦法112年12月8日訂定，連江縣污水下水道使用費徵收自治條例100年8月8日訂定，事業用戶接管後繳下水道使用費而不是水污費。專責人員依廢（污）水處理專責單位或人員設置及管理辦法：餐飲旅宿、酒廠、食品與畜牧多不含附表二物質，許可核准量一百至未滿二千立方公尺乙級、二千至未滿五千甲級、五千以上設專責單位，納管或委託處理者三百起算乙級；含附表二物質超標者未滿二百乙級、二百至未滿一千甲級、一千以上專責單位；離職異動十五日內報備、代理不逾三個月，澎湖有水污專責設置流程圖，違反依《水污染防治法》第48條第3項處一萬元以上十萬元以下按次。
離島的失敗代價與連動：無證停工、繞流、三縣檢舉獎勵比例差很多、下水道法與沒有農田水利署的搭排
《水污染防治法》第45條的三個級距要分清：未取得排放許可即排放六萬元以上六百萬元以下並應令全部停工或停業且無限期改善，未依登記事項運作同額並限期補正按次處罰，登記事項變更未先申請一萬元以上六十萬元以下。接著是第40條：違反放流水標準六萬元以上二千萬元以下並限期改善，屆期按次處罰，情節重大停工停業或廢止許可，畜牧業改為六千元以上六十萬元以下；第46條違反檢測申報管理辦法一萬元以上六百萬元以下；第46條之1的繞流、稀釋或處理設施功能不足六萬元以上二千萬元以下；第44條水污費逾期九十日未繳六千元以上三十萬元以下；第73條七款情節重大公開並三年不得享政府優惠；停工停業後依第63條檢具改善計畫申請試車、最長三個月；申報不實另有刑事責任的規定。三縣的檢舉獎勵比例差很多：澎湖縣民眾檢舉違反水污染防治法案件獎勵辦法106年6月7日訂定，重大情形以實收罰鍰百分之二十發給、其他百分之十、受僱人上限百分之五十，門檻實收罰鍰六萬元；金門縣檢舉違反水污染防治法案件獎勵辦法106年9月15日訂定、114年7月14日修正，重大情形以百分之五為上限、其他百分之一、受僱人百分之十，門檻十萬元；連江縣獎勵民眾檢舉違反水污染防治法案件辦法104年7月7日訂定、109年9月18日修正，重大情形百分之二十為上限、其他百分之十、受僱人百分之五十。接管的事業改對下水道法與縣法規：下水道法第22條排水設備檢驗合格才能聯接、第25條納管水質超標限期改善情節重大停止使用、第32條處一萬元以上十萬元以下且三次仍未改善得停止使用或報請停業，連江的用戶排水審查與下水道法規裁處在資源管理科，107年1月18日訂連江縣下水道管理規則，環境資源局2024年6月11日公開提醒廚餘不得傾倒雨水下水道、違者開罰。三縣不在農田水利署十七個管理處轄區，沒有圳路搭排這條程序，排入公共排水溝渠的事業直接對《水污染防治法》與水利主管機關的排水設施規定。未達事業門檻的小型餐飲、印刷、染色業者則落在113年1月16日修正的禁止足使水污染行為公告，排放影響水體依第52條處三萬元以上三百萬元以下。
離島在地事實對業者的意義：先問接管、水庫就在隔壁、優養化的氮磷、油脂截留補助與海洋放流
第一個意義是先問能不能接管：三縣沒有工業區專用系統，公共污水下水道是唯一免許可免水污費免申報的出口，連江的資源管理科掌家戶接管與用戶排水審查、金門公告下水道使用區域並對未接管家戶收水污費，能接就接。第二個意義是水庫就在隔壁：澎湖六座、金門十一座水庫保護區把平地切成一格一格，餐飲旅宿、畜牧與食品廠選址先用環境部飲用水水源水質保護區查詢系統確認，區內門檻減半、禁設污染性工廠、放流水加嚴。第三個意義是優養化把氮磷推到前面：金門各湖庫卡爾森指數均優養化，太湖、榮湖整治規劃進行中，排入集水區的酒廠與畜牧廢水要把氨氮與正磷酸鹽處理寫清楚。第四個意義是餐飲油脂有補助：連江環境資源局115年3月2日訂補助油脂截留設施作業要點，對象是轄內經目的事業主管機關核准登記立案的餐飲業者，未設置者優先，申請自公告日起至當年度10月1日止，設了油脂截留才好接管。第五個意義是排海不是免管：海洋放流仍是排放於地面水體，要許可、要檢測申報、要對海洋污染防治法，只是免水溫限制。第六個意義是檢舉獎金高：澎湖與連江重大情形給實收罰鍰百分之二十、受僱人上限百分之五十，離島的員工檢舉誘因比本島高，內部管理要跟上。第七個意義是工廠先填檢核表：金門新設工廠先填工廠應取得環保許可文件自我檢核表並向檢核表所列諮詢窗口確認，連江工廠登記的環保許可在環境管理科分機160，澎湖照申辦業務作業流程圖走。
離島在地窗口與線上申辦：三局地址電話、分機、陳情管道與救濟
澎湖縣政府環境保護局位於湖西鄉大城北6-1號，電話06-9221776、06-9221778、06-9221779、06-9221781，服務時間週一至週五八點到十二點、十三點半到十七點半，水污染防治許可與稽查處分洽公害防治科，陳情專區與公害污染陳情受理在局網，環境部報案中心一覽表列06-9221778轉9，縣府另有申辦服務入口。金門縣環境保護局位於金湖鎮正義里尚義100號，總機082-336823、傳真082-334438，環保報案專線0800-056-580，水污染防治許可洽水質保護科、公害陳情業務分機111，業務申辦流程頁有水污染防治網路申請（報）作業與工廠申請相關事項，資訊公開頁有重大點源放流水自動連續監測資訊與河川湖庫水質檢驗值報告。連江縣環境資源局位於南竿鄉復興村214-3號，電話0836-26517到26520、傳真0836-25387，工廠登記環保許可洽環境管理科分機160，事業廢水管理與稽查處分洽污染防治科分機260，用戶排水審查與下水道使用費洽資源管理科分機120，局網有民眾陳情、事故通報與污水下水道圖資及使用費徵收專區。三縣送件本體都在環境部環境保護許可管理資訊系統，縣法規分別查澎湖縣政府主管法規查詢系統環保分類二十四筆、金門縣政府主管法規共用系統環境保護類六十一筆、連江縣政府主管法規共用系統環資類二十筆。裁處書送達後，先在期限內提出陳述意見，仍不服再依廠址向澎湖縣政府、金門縣政府或連江縣政府提起訴願。
自我檢查清單
- 先問公共污水下水道能不能全量接管，接管者免許可免水污費免申報，連江洽資源管理科分機120、金門查下水道使用區域公告
- 用事業分類及定義公告對照：餐飲旅宿五十立方公尺或客房七十五間、酒廠食品廠每日二十立方公尺、養豬二十頭，保護區內減半
- 選址前用環境部查詢系統確認澎湖六座、金門十一座水庫的飲用水水源水質保護區，區內禁設污染性工廠、放流水加嚴
- 排入金門太湖、榮湖等優養化湖庫集水區者把氨氮與正磷酸鹽處理寫進水污染防治措施計畫
- 在環境部環境保護許可管理資訊系統送件，審查十日加二十日、補正總計不超過四十二日，澎湖照申辦流程圖、金門先填工廠環保許可文件自我檢核表
- 排海者仍要許可與檢測申報，免水溫限制但其他項目照管，另對海洋污染防治法
- 連江餐飲業者向環境資源局申請油脂截留設施補助，未設置者優先、當年度10月1日截止
常見錯誤
- 以為離島沒有工業區就沒人管廢水——三縣都在《水污染防治法》事業分類公告之下，無證排放依第45條六萬元起並應令停工
- 排海就當成不用許可——海洋放流是排放於地面水體，要許可、要申報，只是放流水標準免水溫限制
- 把家戶水污費當事業費率——金門與連江的家戶水污費辦法是家戶端，事業水污費依中央收費辦法，接管後改繳下水道使用費
- 廚餘與油脂直接進下水道——連江環境資源局公開提醒廚餘不得傾倒雨水下水道，油脂截留設施有補助卻不裝就先被罰
- 水庫集水區內照通用門檻算——澎湖六座、金門十一座保護區內事業門檻減半、禁設污染性工廠、放流水加嚴
- 展延等到期滿才辦——申請窗口是期滿前六個月至一個月，期滿翌日失效就要重新申請
官方參考資料
常見問題
澎湖 金門 馬祖 餐廳 民宿 廢水 要辦排放許可嗎？
先看事業分類：餐飲業與觀光旅館含旅館、民宿、泡湯場所，每日最大廢水量五十立方公尺以上，或餐飲座位五百人、作業環境面積一千五百平方公尺、客房七十五間、湯屋二十五間以上才是《水污染防治法》的事業，落在水庫飲用水水源水質保護區內門檻減半。達門檻且排放廢水於地面水體者依第14條申請排放許可證或簡易排放許可文件，排海也算；能全量接進公共污水下水道者免許可免水污費免申報，連江洽環境資源局資源管理科分機120，金門查下水道使用區域公告。未達門檻者仍受禁止足使水污染行為公告約束，連江餐飲業者可申請油脂截留設施補助，澎湖環保局有餐飲業管理法規及污染防制實務可參考。
金門 酒廠 食品廠 廢水 排到 水庫 集水區 會怎樣？
金門縣劃定太湖、榮湖、田浦水庫、擎天水庫、西湖、菱湖、蓮湖、陽明水庫、瓊林水庫、金沙水庫、山西水庫十一處飲用水水源水質保護區，區內依《飲用水管理條例》第5條禁止設置污染性工廠等行為，事業分類門檻減半，放流水另適用氨氮十、正磷酸鹽四點零、硼一點零毫克每公升的加嚴值。金門環保局業務頁寫明各湖庫卡爾森指數均屬優養化，正推動太湖、榮湖水庫污染整治規劃與初步設計，酒類與食品醱酵廢水的氮磷是審查重點；環保局對列管事業廢污水檢測八項並公開重大點源放流水自動連續監測資訊。新設工廠先填109年2月24日的工廠應取得環保許可文件自我檢核表，許可洽水質保護科，總機082-336823。
離島 排放許可 沒辦 罰多少 檢舉獎金 幾成？
《水污染防治法》第45條規定未取得排放許可即排放，處新臺幣六萬元以上六百萬元以下罰鍰並應令事業全部停工或停業，沒有限期改善；違反放流水標準依第40條處六萬元以上二千萬元以下、畜牧業六千元以上六十萬元以下；繞流或稀釋依第46條之1處六萬元以上二千萬元以下。檢舉獎勵三縣不同：澎湖重大情形以實收罰鍰百分之二十發給、其他百分之十、受僱人上限百分之五十，門檻實收罰鍰六萬元；金門重大情形百分之五為上限、其他百分之一、受僱人百分之十，門檻十萬元；連江重大情形百分之二十為上限、其他百分之十、受僱人百分之五十。裁處書送達後先在期限內提陳述意見，不服再向所在縣政府提起訴願。
離島水污許可初判
把行業別、每日用水與廢水量、廠址在澎湖金門連江哪一處、廢水排海還是排溝渠或能否接管傳給偉騰，我們先判斷你是不是水污染防治法的事業、有沒有落在水庫保護區、該辦排放許可證還是簡易排放許可文件、該找哪一局哪一科。免費書面初判，電話 0965-855-538，或加 LINE 直接傳資料。
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創辦人謝清泉為前臺東縣環境保護局局長、前臺東地檢署檢察事務官、前臺東縣政府消費者保護官，中央警察大學法律學研究所畢業，具地政士與不動產經紀人國家證照。服務臺東全縣 16 鄉鎮及全台各縣市——任何業務直接聯絡偉騰，全台各地均有配合團隊，可安排專人親臨現場指導。
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