水污染許可流程每一站誰收錢：工廠廢水排放許可申請與水污染防治措施計畫申請的費用分工表

作者 Bo Wei・偉騰開發興業有限公司・發布 2026-10-31・更新 2026-10-31（由前臺東縣環境保護局局長謝清泉主持）

水污染許可流程會付錢的站不只一處：縣市環保局收審查規費、環境部體系徵收水污染防治費、許可檢驗測定機構收檢測費、專責人員與設備廠商各有費用，顧問服務費另計。本文只講哪一站誰收、依什麼計，不列任何金額。

一句話總結：工廠廢水排放許可申請從頭到尾，付錢的對象有四種，分別是主管機關的規費與水污染防治費、許可檢驗測定機構的檢測費、專責人員與處理設備的人與設備成本，以及撰擬文件的顧問服務費。

每一種費用發生在水污染許可流程的不同站，計算基礎也不同，混在一起問「總共多少」得到的答案一定不準。

最容易被誤判的直覺是「許可規費就是全部」。審查規費在整體支出裡通常不是最大的一塊，真正隨規模放大的是定期檢測、水污染防治費與處理設備的維持成本，而且這些是許可拿到之後每年都會再發生的費用。另一個誤解是把顧問服務費與法定費用混為一談，兩者收取者不同、依據不同，報價單上要能分開看。

本文依《水污染防治法》與兩部子法的條文，把費用發生點排成八站：水污染防治措施計畫申請、排放許可證或簡易排放許可文件申請、功能測試與定期檢測申報、水污染防治費、專責人員與處理設備、許可展延與變更、裁罰與救濟、委託前的費用邊界。

每一站只回答三件事：誰收、依什麼計、什麼情況下會再收一次。金額一律不列，實際規費以各縣市環保局公告為準。

水污染防治許可申請的費用總圖：四種收取者

工廠廢水排放許可申請會接觸的收費主體可以分成四種。

1. 第一種是主管機關，縣市環保局依規費法與自訂的收費標準收許可審查規費，環境部體系依《水污染防治法》第 11 條徵收水污染防治費。
2. 第二種是第三方機構，依第 23 條取得許可的檢驗測定機構收採樣與檢測費，專責人員訓練機構收訓練費。
3. 第三種是設備與工程廠商，處理設施的設計、施作與維護費依工程契約。
4. 第四種是顧問，撰擬水污染防治措施計畫與許可文件的服務費依委任契約。

把報價單上的每一行歸到這四類，就能看出哪些是法定、哪些是可議價的。

水污染防治措施計畫申請階段：審查規費與顧問服務費

《水污染防治法》第 13 條規定事業在設立或變更前，要先檢具水污染防治措施計畫送審。這一站會發生兩筆費用。一筆是縣市環保局的審查規費，依各縣市公告的收費標準計收，通常以件計，補正不另收但退件重送要再繳一次。

另一筆是撰擬計畫書的顧問服務費，依委任契約約定，計畫書的複雜度取決於製程廢水股數、處理單元數量與排放去向是納管還是放流。本所服務費於了解案情後個別說明，不公開於網站；水措計畫的審查規費由申請人直接繳給環保局，不經過顧問。

工廠廢水排放許可申請階段：排放許可證與簡易排放許可文件

設施完成後，依《水污染防治法》第 14 條，排放廢（污）水前要取得排放許可證或簡易排放許可文件。

走哪一種決定了這一站的費用結構：依《水污染防治措施計畫及許可申請審查管理辦法》第 2 條，一般對象廢水量達每日一百立方公尺以上者申請排放許可證，文件較完整、審查規費較高；符合條件的較小規模事業走簡易排放許可文件，規費與文件都較精簡。

兩者的規費都由縣市環保局依公告收費標準計收，申請人直接繳納。許可類型判錯送錯件，退回重辦就是多繳一次規費加上一輪時間。

功能測試與定期檢測申報：許可檢驗測定機構的費用

這一站是許可拿到後持續發生、最常被低估的費用。依審查管理辦法第 13 條與第 15 條，處理設施完成後要辦功能測試，測試期間的採樣檢測由申請人委託合格機構執行。依《水污染防治法》第 22 條，事業要定期檢測放流水並申報；第 23 條規定檢測要委託取得許可的檢驗測定機構。

頻率依《水污染防治措施及檢測申報管理辦法》第 86 條，原則每六個月申報一次，設有甲級專責人員或專責單位者每三個月一次。檢測費依機構報價，按檢測項目數與頻率計，項目數由適用的放流水標準決定，業別限值愈多、單次費用愈高。

水污染防治費：依排放量與水質計徵的法定費用

《水污染防治法》第 11 條是水污染防治費的法源，由主管機關向排放廢（污）水的事業徵收，計費基礎是排放的水量與污染物濃度，申報與繳納有固定週期。這筆費用與許可規費是兩回事：規費是申請程序的一次性成本，水污費是只要排放就每期都要繳的費用。

影響金額的變數掌握在事業自己手上，處理設施維持得好、排放濃度低，水污費就低；申報資料與檢測數據對不上，則可能被追繳加徵。本文不列費率，計算方式以環境部公告的收費辦法為準。

水污染防治許可申請的人與設備成本：專責人員與處理設施

依《水污染防治法》第 21 條，達一定規模的事業要設置廢（污）水處理專責單位或專責人員，級別與人數依廢水量級距而定，級距門檻在專責人員設置辦法的附表。

這一站的費用有兩種型態：

• 自行培訓員工取得資格者，付的是訓練機構的訓練費與人事成本；
• 委託設置者，付的是委託契約的費用。

處理設施的費用則依工程契約，設計與施作一次性、藥劑與維護持續性。審查端看的是計畫書寫的處理單元與現場設備是否一致，所以設備規格決定之後才估文件費，順序顛倒會改兩次。

許可展延與變更：再收一次規費的時點

依《水污染防治法》第 15 條，排放許可證與簡易排放許可文件的有效期間為五年，展延要在期滿前六個月起、五個月內提出。展延申請要再繳一次審查規費，金額依各縣市公告，與初次申請的規費是分開的收費項目。

製程、水量或排放去向變更時，依第 14 條要先申請變更，變更審查同樣有規費。這一站的費用風險不在規費本身，而在錯過展延窗口：許可失效後重新申請，等於把水措計畫到排放許可的規費與文件費再付一輪。把展延時點登進行事曆，是整條水污染許可流程裡成本最低的一件事。

水污染許可流程的裁罰與救濟：費用邊界在哪裡

未取得許可排放、放流水超標或未依規定檢測申報，依《水污染防治法》第 46 條等罰則處罰鍰並限期改善，罰鍰金額由主管機關裁量。救濟這一站的費用是顧問撰擬陳述意見書與訴願書的服務費，訴願要在處分書送達之次日起三十日內提起，本身不收規費。

依《行政罰法》第 18 條，採樣日的作業狀態、改善承諾與具體時程是裁量審酌的事項，陳述意見階段提出才有意義。本所承辦陳述意見與訴願，不承辦訴訟事件，實際結果依事實與證據而定。

委託水污染防治許可申請前，先把費用問清楚的五件事

1. 第一，法定規費與顧問服務費要分開列，規費由申請人直接繳給環保局。
2. 第二，檢測費要問清楚項目數與頻率，兩者由放流水標準與第 86 條的申報頻率決定。
3. 第三，水污費是持續費用，要問自己的排放量級距與濃度落在哪裡。
4. 第四，專責人員是自訓還是委託，兩種型態的費用結構不同。
5. 第五，展延與變更會再收規費，時點要寫進契約的服務範圍。

把製程說明、用水來源、廢水產生點與去向、既有設施照片與已收到的公文整理好，加 LINE「偉騰開發」傳資料，免費書面初判會回覆許可類型與各站費用的發生點；水污染防治許可申請全台各縣市皆可受理，由前臺東縣環境保護局局長把關審查端視角。

自我檢查清單

• 報價單上的每一行歸到規費、水污費、檢測費、人與設備、顧問服務費五類
• 許可類型先判對：排放許可證還是簡易排放許可文件，規費與文件深度不同
• 檢測項目數依適用的放流水標準確認，申報頻率依第 86 條確認
• 水污染防治費的申報週期與計費基礎列入年度行事曆
• 專責人員自訓或委託的費用型態在設備規格定案後再估
• 許可有效期間五年，展延窗口期滿前六個月起算，時點寫進契約服務範圍

常見錯誤

• 以為審查規費就是全部，忽略每年都會再發生的檢測費與水污費
• 顧問服務費與法定規費混在一張報價裡，看不出哪些是可議價的
• 設備規格還沒定就先寫計畫書，審查比對現場後要求補正，文件費付兩次
• 錯過展延窗口讓許可失效，整條流程的規費與文件費重付一輪
• 收到裁處書先觀望，陳述意見期限過了，裁量審酌的空間直接歸零

官方參考資料

• 水污染防治法：水污費、水措計畫、排放許可與專責人員的條文（法務部全國法規資料庫）
• 水污染防治措施計畫及許可申請審查管理辦法：許可類型與功能測試（法務部全國法規資料庫）
• 水污染防治措施及檢測申報管理辦法：定期檢測與申報頻率（法務部全國法規資料庫）
• 環境部水質保護網：水污染防治業務與公告

常見問題

水污染防治措施計畫申請的審查規費是誰收？

由受理的縣市環保局依規費法與自訂收費標準計收，申請人直接繳納，不經過顧問。退件重送要再繳一次，補正通常不另收。

簡易排放許可文件比排放許可證便宜嗎？

文件較精簡、規費通常較低，但能不能走簡易路徑取決於事業分類與廢水量條件，不是自己選的。判錯類型送錯件，退回重辦反而多付一次。

許可拿到之後每年還要付哪些錢？

定期檢測費、水污染防治費、處理設施的藥劑與維護費，以及專責人員的人事或委託費；五年到期前的展延另有審查規費。

把費用分站問清楚

水污染許可流程的費用問題，正確的問法是「哪一站、誰收、依什麼算」。整理好製程與排放去向資料後傳給偉騰，書面初判會把您的案件落在哪些費用發生點逐站標出來，法定規費依各縣市環保局公告計收，服務費於了解案情後個別說明。

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